阴离子絮凝剂适用于中性和碱性环境，阳离子絮凝剂、非离子絮凝剂适用于酸性和中性环境。不同的絮凝剂能够在不同的酸碱度环境下使用，跟其分子结构有着直接的关系。

阴离子絮凝剂适用于碱性和中性环境，对于固体微粒表面带正电荷的体系絮凝效果较好。阴离子絮凝剂应用范围较广，目前市场上绝大部分都是弱阴离子型，水解度为26%左右。  

非离子絮凝剂适用于固体微粒表面净电荷低的体系，一般可用于酸性或近中性的水质。

阳离子絮凝剂，由于其水溶液带有正电荷，可将含有负电荷的悬浮物迅速絮凝沉淀下来。在酸性条件下，有机物容易结合氢离子，但是其中的羟基、羧基、酰胺基等仍然有电负性，以及可以发生氢键作用，因此容易和阳离子聚丙烯酰胺作用，同时阳离子絮凝剂的季铵盐离子结合质子不是太牢固，仍和大的有机物发生作用。但酸性太强，就失去效果了。

若酸性较强可以先投加聚合氯化铝，由于聚合氯化铝呈碱性可起到中和的作用，同时聚合氯化铝可将酸性废水中的悬浮颗粒絮凝成为细小的絮团，然后投加絮凝剂可以的更好的发挥絮凝沉淀作用。