菌操作区
菌操作区是只限于细胞培养及其他菌操作的区域，能与外界隔离，不能穿或受其他扰。在般环境的空中，由于存在许多尘埃和杂菌，较易造成污染。因此，接种作要在空经过灭菌的环境进，规模的菌环境可利超净作台创造，规模的需建菌室。理想的菌操作室应划为三部分：
a) 更室―供更换服、鞋及穿戴帽和罩。
b) 缓冲间―位于更间与操作间之间，于准备作，还有防污染的作，以***操作间的菌环境，同时可放置恒
温培养箱以及必需的型仪器。
c) 菌操作间―菌操作间则专于菌操作、细胞培养，其要适当，且其顶部不宜过以***紫外线的灭菌效果；墙壁光滑死以便清洗和消毒，菌操作间容积且为密闭式，般菌操作间的空消毒紫外线灯，有的实验室使臭氧紫外线消毒器或电消毒灭菌器。
净化作台：操作简单，安装便，占空间且净化效果很好。般细菌培养室使的净化作台主要有两种：
a)侧流式或称垂直式 b)外流式或称平层流式。
孵育区
孵育区也称培养区，本区对菌的要求虽不菌区严格，但仍需清洁尘，因此也应设置在扰少来往穿的区域。孵育可在孵箱或可控制温度的温室中进，后者费，般实验室多采孵箱进作。
制备区
制备区主要进培养液及有关培养的液体等的制备。应设有试剂柜、器械柜、实验台和上道、电源等，配备的主要仪器设备有纯化装置、天平、微波炉、pH计、抽泵、电炉、培养分装器、各种规格的培养瓶、培养、移液管、烧杯、量筒、容量瓶等。在有天平、pH计、磁拌器等设备下完成制备以后，应在菌操作台进过滤***。液体制备直接关系组织细胞养的成败，因此必须严格菌操作。
储藏区
储藏区主要存放各类冰箱、燥箱、液氮罐、菌培养液、培养瓶等，此环境也需要清洁尘。为了保存细胞，特别是不易获得的突变型细胞或细胞株，要将细胞冻存。冻存的温度般为液氮温度-196℃。
细胞的冻存过程需要系列程序降温，般为4 ℃下存放30min。转放-20 ℃ 1 h，再转-80—-70℃过夜，之后才可以转移到液氮内(-196℃)。因此储存区必须配备冰箱、低温冰箱、***温冰箱和液氮罐等设备。
清洗和消毒灭菌区
清洁和消毒灭菌区应与其他区域分开，主要进所有细胞培养器的清洗、准备、消毒及三蒸制备等作，应备有压蒸汽灭菌锅、细菌过滤设备、电热燥箱、消毒柜、排风设备等。
